計(jì)算模擬全新多肽：在自然法則框架下的定向創(chuàng)造與拓展

這一結(jié)論的得出，可通過(guò)對(duì)比 “揭示自然可能” 與 “人類純粹創(chuàng)造” 兩種視角，深入理解計(jì)算模擬多肽的本質(zhì)內(nèi)核：

科學(xué)實(shí)踐：兩種視角的融合與拓展

設(shè)計(jì)策略的哲學(xué)光譜：從 “揭示” 到 “創(chuàng)造” 的梯度分布

1. 從頭設(shè)計(jì)：最接近 “創(chuàng)造” 的一端?？蒲腥藛T給定目標(biāo)三維結(jié)構(gòu)或功能（如 “緊密結(jié)合某病毒蛋白”），從零開(kāi)始生成全新多肽序列。這類產(chǎn)物大概率是自然進(jìn)化從未產(chǎn)生的，但它們能形成穩(wěn)定構(gòu)象的特性，本身就是自然法則允許其存在的證明。
2. 基于天然模板的理性設(shè)計(jì)：更偏向 “揭示” 的一端。通過(guò)分析天然多肽的結(jié)構(gòu) - 功能關(guān)系，對(duì)關(guān)鍵位點(diǎn)進(jìn)行突變，以此優(yōu)化多肽性能，比如增強(qiáng)穩(wěn)定性、降低免疫原性。這一過(guò)程，本質(zhì)是探索天然模板周圍的 “生物化學(xué)可能性空間”。
3. 虛擬篩選與 AI 生成：位于光譜的中間地帶。借助技術(shù)手段從海量虛擬多肽庫(kù)中篩選候選序列，或由人工智能模型自主生成新序列。AI 模型雖從自然數(shù)據(jù)中學(xué)習(xí)規(guī)律，但其生成的新穎序列組合，往往超出人類直覺(jué)范疇，可視為對(duì)自然可能性空間的一次 “高效測(cè)繪與填充”。

結(jié)論與啟示：開(kāi)啟藥物研發(fā) “按需定制” 新時(shí)代